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microRNA靶真人投注平台分析croRNA靶真人投注平台分析

芯片差异microRNA靶真人投注平台分析
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                             芯片差异microRNA靶真人投注平台分析
分析方案一
1.通过搜索TargetScan,Mirbase, Miranda三大数据库得到差异microRNA调控的所有靶真人投注平台。
2.通过对上调或下调microRNA对应的靶真人投注平台进行GO显著性功能分析,得到具有显著性、低误判率、靶向性的GO功能集以及对应的靶真人投注平台。

3.通过对上调或下调microRNA对应的靶真人投注平台进行KEGG Pathway显著性分析,得到具有显著性、低误判率、靶向性的KEGG Pathway以及对应的靶真人投注平台。

4.通过对靶真人投注平台的显著性GO功能集分析和显著性Pathway分析,将GO和Pathway所包含的靶真人投注平台取交集。
5.根据第4步得到的靶真人投注平台构建差异microRNA与靶真人投注平台的调控网络,得到网络中起核心调控作用的microRNA和被microRNA调控的关键靶真人投注平台。

分析方案二
1.通过TargetScan, Mirbase, Miranda预测单个microRNA靶真人投注平台。
2.三个软件预测的前200个靶真人投注平台,两两之间取交集选取共同靶真人投注平台。
3.每个软件前50个靶真人投注平台与另外两个软件预测的所有靶真人投注平台相比,选取共同靶真人投注平台。
4.三个软件预测的前10个靶真人投注平台,如不在真人投注平台列表之内的,则加入列表中。
5.根据第4步得到的靶真人投注平台进行显著性GO功能集分析和显著性Pathway分析,将GO和Pathway所包含的靶真人投注平台取交集。
6.所得靶真人投注平台根据三个软件总得分排序(各自得分做标准化相加)。
7.根据第5步得到的靶真人投注平台构建差异microRNA与靶真人投注平台的调控网络,得到网络中起核心调控作用的microRNA和被microRNA调控的关键靶真人投注平台。


   



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