单细胞外显子组测序发现肾细胞癌干细胞三个驱动真人投注平台基因KCP, LOC440040 真人投注平台
栏目:最新研究动态 发布时间:2017-11-08
肾细胞癌(RCC)占成人恶性肿瘤3%。肿瘤干细胞在肾癌发生、发展和耐药性产生中起重要作用......

细胞外显子组测序发现肾细胞癌干细胞三个驱动真人投注平台基因KCP, LOC440040 真人投注平台

    肾细胞癌(RCC)占成人恶性肿瘤3%。肿瘤干细胞在肾癌发生、发展和耐药性产生中起重要作用。最近,单细胞外显子组测序已被用于评估多类肿瘤的体细胞真人投注平台,尚未系统地运用于识别肿瘤干细胞的关键驱动基因。作者从RCC病人体内分离CD133+RCC 和CD133–RCC 细胞,发现只有CD133+RCC 细胞具有 sphere-forming capability。将CD31–CD45– ,CD31–CD45–CD133–,和CD31–CD45–CD133+RCC分别皮下注射到NOD/SCID小鼠,结果显示注射CD31–CD45–CD133+ 细胞的小鼠可见明显肿瘤,注射其它两类细胞小鼠体内都未发现肿瘤。

    作者又从同一个病人体内分离10个CD133+RCC, CD133–RCC和正常肾细胞进行单细胞外显子组测序,癌组织和癌旁组织进行外显子组测序。发现大部分真人投注平台集中在CD133+RCC中(图1A),KCP基因的c.A241T>p.R81W真人投注平台,LOC440563基因的c.G316A>p.G106S真人投注平台,和LOC440040基因的c.A406T>p.N136Y 真人投注平台。C/G>T/A,A/T>C/G 和A/T>G/C 真人投注平台在RCC中常见,相较于CD133–RCC,A/T>T/A真人投注平台在CD133+RCC中更为常见(图1B)。 通过PCA分析,发现CD133+RCC散乱分布且离正常肾细胞与CD133–RCC较远(图1D)。进化树分析显示正常肾细胞与CD133–RCC距离更近 (图1E)。利用CRISPR-Cas9技术导入20个真人投注平台基因到786-O,发现 KCP真人投注平台促进细胞成球,将余下基因与 KCP 搭配导入细胞,发现LOC440040 与 KCP 协同真人投注平台显著增强细胞成球力。KCP 、LOC440040 、LOC440563 三者协同真人投注平台,效果最佳,将三者真人投注平台的细胞导入小鼠,检测到更多肿瘤。对 57个病人的KCP 、LOC440040 、LOC440563 真人投注平台位点进行Sanger测序,结果显示超过20% 病人至少携带一个真人投注平台(图1H),5.2% 同时携带这三个真人投注平台(图1K)。这些病人切除原发瘤后,肿瘤复发时间明显短于其他人(图1L)。

    

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