tRF调控LTR-反转录真人投注网站
栏目:最新研究动态 发布时间:2017-09-15
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tRF调控LTR-反转录真人投注网站

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背景简介

1真人投注网站(Transposon),是真核生物基因组中普遍存在的一类可移动的遗传因子。它们在基因组中通过转录或逆转录,在内切酶的作用下,在其他基因座上出现。I型是反转录真人投注网站,在转座时先转录成RNA,再反转录成DNA,插入到新的染色体位点,包括长末端重复类反真人投注网站LTR  retrotransposons,末端具poly-A尾巴或者As。根据转座的自主性,这类元件又可以分为自主转座元件和非自主转座元件,前者本身能够编码转座酶而进行转座,后者则需在自主元件存在时方可转座

2 逆转录酶的作用是以dNTP为底物,以RNA为模板,tRNA(主要是色氨酸tRNA)为引物(大部分LTR逆转录真人投注网站需要利用tRNA增殖,根据结合的tRNA进行分类,最活跃的是ERV-K)在tRNA3′H末端上,按5′→3′方向,合成一条与RNA模板互补的DNA单链,这条DNA单链叫做互补DNA(complementary DNA, cDNA),它与RNA模板形成RNADNA杂交体。随后又在反转录酶的作用下,水解掉RNA链,再以cDNA为模板合成第二条DNA链。至此,完成由RNA指导的DNA合成过程。

3 TEs对生物进化有明显影响,比如在基因突变、基因组进化和物种形成方面起重要作用。高等植物的真人投注网站标签法基因研究

       真人投注网站激活使细胞失去表观遗传的沉默,是细胞内源的潜在危险因素。小鼠LTR-反转录真人投注网站即内源反转录病毒导致很多基因插入,并在胚胎植入前的干细胞中组蛋白H3赖氨酸三甲基缺失时大量表达。这些细胞中含大量18nt tRF,并普遍表达22nt tRF,其结构包括成熟tRNAs 3’CCA序列和ERV反转录引物结合位点。作者证实两个ERV家族成员:IAPMusD/Etn是上述两种tRF主要目标,反转录转座实验被tRFs显著抑制。22nt tRF发挥miRNA功能,使ERV转录沉默,18nt主要干扰反转录和真人投注网站移动。tRF通过与发挥反转录引物作用的tRNA竞争性结合PBS(primer bingding site),抑制ERV第一条cDNA链的合成,这是sRNA介导的真人投注网站调控的潜在机制。

       真人投注网站元件和它的重复序列驱动转录可以重组染色体,引发异染色体,但是TE移动能力受严格的控制。TE转录通常被表观遗传如DNA甲基化或者组蛋白修饰所抑制。干细胞利用基因组程度的遗传外重编程获得多样性并且从而释放TE转录控制。DNMT1引起的DNA甲基化抑制非LTR的元件和少部分LTR-逆转录真人投注网站,但是SETDB1抑制大部分LTR-逆转录真人投注网站。SETDB1敲除的ESCS 没有H3K9甲基化,表达ERV,变成类滋养层,移植到胚胎的时候变成胎盘。

 

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