三阴性乳腺癌中isomiRs和tRFs的作用研究
栏目:最新研究动态 发布时间:2019-09-05
三阴性乳腺癌(TNBC)是在白人和黑人妇女之间存在标志性差异的一种乳腺癌亚型。作者系统分析了TCGA数据库的数据集,以研究ncRNAs调控mRNA的表达模式......

 Telonis AG and Riqoutsos I. Race disparities in the contribution of miRNA isoforms and tRNA-derived fragments to triple-negative breast cancer. Cancer Research, 2017. IF=9.122
      三阴性乳腺癌(TNBC)是在白人和黑人妇女之间存在标志性差异的一种乳腺癌亚型。作者系统分析了TCGA数据库的数据集,以研究ncRNAs调控mRNA的表达模式。作者研究了isomiRs和tRNA来源的片段(tRFs)。在正常的乳房组织中,作者发现在ncRNA和mRNA层面以及二者之间的关联层面都有显著性的结合作用。这种结合作用在TNBC中广泛地被打断:很多的mRNAs在正常乳房组织和伴有转录本或tRF失调的TNBC中差异表达。在TNBC患者中,isomiRs和tRFs参与的调节通路在不同种族间是不同的。来源于特定的miRNA基因位点和tRNA基因位点的多样的isomiRs和tRFs与TNBC中存在的种族差异具有相关性。作者重点研究了种族特异的转录组,并挑选了差异表达的关键通路中的新陈代谢相关的MAPK通路和Wnt/β信号通路进行详细研究。
研究路线:

研究结果:


图1复合的种族和国家特异性转录组图。


图2 mRNA及其临近基因的表达谱。


图3 短的ncRNA和转录因子可解释mRNA与种族的相关性。


图4 isomiRs和tRFs可能是mRNA差异表达的诱因。


图5 种族特异的与新陈代谢相关的基因及通路。

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