测序在手,文章我有
栏目:最新研究动态 发布时间:2019-08-05
circRNA被鉴定为多种癌症中的重要调节因子,但在LUSC中尚未见报道。于是,一篇影响因子11.878、以测序为基础展开研究的文章应运而生......

肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma ,LUSC)是非小细胞肺癌的主要亚型之一,而非小细胞肺癌占所有人类肺癌的80-85%。circRNA被鉴定为多种癌症中的重要调节因子,但在LUSC中尚未见报道。于是,这篇影响因子11.878、以测序为基础展开研究的文章应运而生。

研究思路如下:
说明: E:\5.微信稿件+文献\7.22-7.26\7.26.png


一、circTP63 is upregulated in LUSC. 测序发现circTP63在LUSC表达上调.

1.通过对测序结果进行分析及实验验证,选定circTP63为研究对象

2.在35对临床样本中进行验证

二、Characteristics of circTP63 in LUSC cells.分析circTP63序列

  1. 分析circTP63序列

  2. 检测细胞系中circTP63的表达,选定SW900、H1703用于功能缺失实验, H226、H2170用于功能获得实验

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三、circTP63 promotes cell proliferation and tumor growth. circTP63促进细胞增殖和肿瘤增长
   细胞实验:

  1. 干扰 circTP63,抑制细胞生长

  2. 过表达circTP63,提高细胞活力

  3. 挽救实验,表明circTP63的确可以促进细胞增殖

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   体内实验:
  利用H2170建立裸鼠异种移植模型,发现circTP63促进肿瘤生长。

四、circTP63 facilitates cell proliferation by targeting FOXM1.circTP63通过FOXM1促进细胞增殖

  1. circTP63、mRNA共表达模式分析,得到25个可能的靶标mRNA,其中FOXM1,KIF18B和BRCA1相关性位居前三

  1. 对测序结果进行分析,发现FOXM1在LUSC中显著上调

  1.  在35对临床样本中验证FOXM1的表达,并检测circTP63与mRNA表达的相关性,最终,选定FOXM1为主要候选目标。


五、circTP63 relieves repression of miR-873-3p on FOXM1.circTP63具有ceRNA功能通过预测选定miR-873-3p后,利用荧光素酶报告系统、免疫沉淀进行验证。
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六、CENPA and CENPB are regulated by circTP63 through FOXM1.circTP63通过调控FOXM1进而调控CENPA/B,促进细胞增殖

  1. 过表达circTP63,检测8个候选基因表达水平发现,CENPA,CENPB, CCNB1受circTP63调节

  2. 干扰FOXM1,circTP63对CENPA和CENPB的作用显著减弱

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3.敲除CENPA和CENPB同时过表达circTP63,circTP63对细胞增殖的促进作用降低
 
综上所诉,circTP63作为ceRNA调控FOXM1,促进肺鳞状细胞癌的发展。


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